CV


Diplômes et formation initiale

2016 Doctorat en Modèles, Méthodes et Algorithmes en Biologie, Santé et Environnement, Université Grenoble-Alpes, Grenoble.
2011 Master Écologie, Biodiversité, Évolution, Université Pierre et Marie Curie, Paris.

Parcours “Écologie Évolutive”.
2008 Licence de Biologie, École Normale Supérieure d’Ulm, Paris.


Expérience de recherche

Jan. 2018 – Sep. 2019
Post-doctorat, Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive, CNRS, Montpellier, France.

Encadrant: Luis-Miguel Chevin

Adaptation avec fluctuation de la sélection : approches génomiques et phénotypiques en populations naturelles.

2017-2019 Consultant scientifique à distance, Centre d’Investigation Clinique, CHU, Nancy, France.

Consultant scientifique pour Dr. Nicolas Girerd sur l’étude par génétique quantitative de la cohorte STANISLAS.
Sep. 2016 – Avril 2018 Post-doctorat, 16 mois, University of Auckland, Auckland, New Zealand.

Encadrants: Anna Santure et Patricia Brekke.

Prédire le potentiel adaptatif d’une espèce menacée néo-zélandaise, le hihi (Notiomystis cincta) à l’aide d’outils de la génomique et de la génétique quantitative.

Mars – Juil. 2016 Post-doctorat, 5 mois, Laboratoire d’Écologie Alpine, Université Grenoble – Alpes, Grenoble, France.

Encadrant: François Pompanon.

Patrons adaptatifs génétiques et épigénétique chez deux espèces domestiquées: le mouton (Ovis aries) et la chèvre (Capra hircus).

Jan. 2012 –

Jan. 2016

Thèse de doctorat, Laboratoire d’Écologie Alpine (LECA), Université Joseph Fourrier, Grenoble, France.

Directeurs : Oscar Gaggiotti et Irène Till-Bottraud.

Méthodes pour l’étude de l’adaptation locale et application au contexte de l’adaptation aux conditions d’altitude chez la plante alpine Arabis alpina.

Jan. – Déc. 2011 Stage de recherche, 11 mois, Laboratoire de biométrie et biologie évolutive (LBBE), Université Claude Bernard, Lyon, France.

Encadrant : Blandine Doligez et Olivier Gimenez.

Modèles et méthodes pour l’estimation de l’héritabilité des traits binaires en populations naturelles : une étude par simulation et une étude de cas sur l’âge à première reproduction chez le gobe-mouche à collier (Ficedula albicollis).

Jan. – Juin 2010 Stage de recherche, 5 mois, Simon Blomberg’s Lab, University of Queensland, Brisbane, Australia.

Encadrant : Simon Blomberg.

Approches bayésiennes pour l’intrégration de l’incertitude phylogénétique dans les analyses comparatives.

Août – Déc. 2010 Stage de recherche, 5 mois, Groupe de recherche sur l’Écologie et le Comportement Animal (GRECA), Université du Québec à Montréal (UQÀM), Montréal, Canada.

Encadrant : Luc-Alain Giraldeau.

Étude de la personnalité animale dans le contexte de la sélection sexuelle et des stratégies d’approvisionnement.

Fév. – Juin 2009 Stage de recherche, 4 mois, David Reznick’s Lab, University of California – Riverside, Riverside, California (U.S.A.).

Encadrant : Andrés Lopèz-Sepulcre.

Réponse fonctionnelle de prédation avec compétition intra- et inter-spécifique.

Juin – Juil. 2008 Stage de recherche, 2 mois, Laboratoire Écologie, Systématique, Évolution (ESE), Université Paris-Sud, Orsay, France.

Encadrant : Jean-Michel Guillon.

Évolution de la dispersion et du sex-ratio dans un environnement spatialement et temporellement variable.

Compétences


Scientifiques

Biologie
    • Biologie évolutive
    • Génétique quantitative
    • Génomique des populations
    • Écologie
    • Analyses comparatives phylogénétiques
Mathématiques
    • Probabilités
    • Algèbre linéaire
    • Analyse


Statistiques / Informatiques

Statistiques
    • Statistiques bayésiennes
    • Modèles linéaires mixtes généralisés (GLMM)
    • Génétique statistique
Bioinformatique et traitement de données
    • R, Awk, BASH Shell
    • SAMtools, FASTQC, BWA, FreeBayes,Blast, Stacks, Gowinda, simuPOP
    • C/C++, Python, Matlab
Systèmes
GNU/Linux, MacOS X, Windows
Bureautique
LATEX, HTML, LibreOffice/Office


Langues

Français
Langue maternelle
Anglais
Courant